V závislosti na tom, jak je skladován, může vydržet různě dlouho.
Neotevřená láhev peroxidu vodíku by měla vydržet alespoň tři roky. Jakmile je láhev otevřena, peroxid vodíku začne postupně ztrácet svou sílu. Pokud je správně skladován (v chladu a suchu, mimo přímé slunce a zdroje tepla), měl by vydržet asi šest měsíců až rok.
Peroxid vodíku je velmi citlivý na světlo a teploty, což znamená, že pokud není správně skladován, může rychle ztratit svou účinnost. Proto by měl být vždy uchováván v tmavé láhvi a na chladném místě.
Pokud není jisté, zda je peroxid vodíku stále aktivní, lze to ověřit jednoduchým testem. Stačí nalít trochu peroxidu vodíku do dřezu nebo misky. Pokud peroxid vodíku začne bublat a pěnit, je stále aktivní. Pokud ne, je pravděpodobně neúčinný a měl by být nahrazen novým.